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これも弾さんお勧め。
今までのクックブックの中では、最も潜在読者が多いクックブックなのではないだろうか。
これはたぶんそうだろうと思う。いろんな人がシェルを使っているはずなので。
昔を知らないから他のものはよくわからないけど。
bash関連では、この「シェルスクリプト基本リファレンス」というのを読んだことがある。あとはけっこうOJTでいろいろと教えてもらったり、他人が書いたシェルを読んで覚えたりしたが、系統立ててはしらない。なんちゃってユーザーなので、オライリー本があればうれしい。